公司組織架構分別為綜合辦公室、黨群人事部、計劃財務部、監察室、總工辦、經營發展部、信息化部等七個職能部門；規劃分院、建筑分院、交通市政分院、景觀分院等四個生產部門；大師工作室、城市建設更新研究中心、閩南傳統建筑研究中心、交通研究中心、大數據中心、技術審查中心等六個研究中心；泉州市住宅建筑設計院有限公司、泉州市房地產測繪隊有限公司、泉州市工程建設監理事務所有限責任公司等三家權屬企業。